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Las tres subvariantes de BA.2 que provocan el aumento de Covid y la eficacia de las vacunas contra ellas

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Según la Organización Mundial de la Salud (OMS), la subvariante Omicron BA.2.75, altamente transmisible, se detectó primero en la India y luego en otros diez países. Todavía no se ha determinado si es clínicamente grave o no, pero los estudios preliminares realizados aquí muestran una enfermedad leve, explica el Dr. Rajesh Karyakarte a Anuradha Mascarenhas

Por qué el Dr. Rajesh Karyakarte

El Dr. Karyakarte, profesor y director del departamento de microbiología del B J Medical College and Sassoon General Hospital (BJGMC), de Pune, es también el coordinador de Maharashtra para la secuenciación del genoma. Como científico principal de la red de laboratorios del Consorcio Genómico SARS-CoV2 de la India, analiza los resultados y los comunica al Centro Nacional de Control de Enfermedades y al gobierno de Maharashtra. Fue en el marco de este proyecto de secuenciación del genoma aquí donde los científicos pudieron dar información concluyente sobre la detección de mutaciones de las variantes Delta y Kappa en febrero y Omicron a mediados de diciembre del año pasado. El equipo está detectando ahora las subvariantes BA.2.38 a BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76.

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El virus parece estar en continua evolución y además de la mutación presente en el BA.2, los tres, BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 han tenido mutaciones adicionales en su genoma que codifican las proteínas de espiga. Estas tres subvariantes han tenido más de nueve cambios en la proteína de la espiga y están escapando a la inmunidad adquirida.

Justo cuando estábamos viendo un descenso de las infecciones por Covid-19, después de un aumento impulsado principalmente por la variante Omicron a principios de este año, se ha producido una tendencia al alza con las nuevas subvariantes como BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76.

Resulta desconcertante que el número de variantes BA.2 siga aumentando a pesar de la disminución de la tercera oleada de Covid-19. Obtuvimos el mismo número de BA.2 y BA.2.38 en nuestras pruebas de secuenciación. Además, estas dos fueron las más dominantes incluso después de la introducción de BA.2.12.1, BA.4 y BA.5 en el panorama de variantes del SARS-CoV-2 en la India, a diferencia de otros países. Estas variantes más alarmantes no ganaban en número. Después de coordinar la secuenciación de 35.103 muestras en el BJGMC de Pune, estaba claro que, tras una gran oleada de BA.2, no se esperaba en absoluto un aumento causado por una BA.2 no mutada. Sin embargo, todas las tuberías bioinformáticas seguían identificando BA.2 en grandes cantidades. Esto estaba empañando nuestra respuesta epidemiológica, ya que no se pueden delinear los grupos de infecciones. Por ello, se planteó la necesidad de segregar BA.2 en la Red Pango, lo que llevó a nombrar los nuevos linajes: BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76. Tras reevaluar los BA.2 previamente identificados, se observa que casi la mitad pertenecen a estos tres linajes. Este hallazgo ayudará a precisar nuestra respuesta epidemiológica a la pandemia de Covid-19. Se espera una nueva clasificación de BA.2 en breve. Es importante señalar que estas tres variantes ya formaban parte de la BA.2 identificada en la oleada actual.

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¿Fue el laboratorio de secuenciación del BJGMC, Pune, el primero en identificar y marcar con rojo los aislados de SARS-CoV-2 identificados como BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 en la India?

Los científicos de la Red Pango encontraron mutaciones únicas en los genomas del SARS-CoV-2 cargados en GISAID por científicos indios. Así, para un mejor rastreo epidemiológico, se sugirieron nuevos linajes para estos aislados. Sin embargo, las subvariantes de Omicron también se encuentran en otras partes del mundo. El laboratorio de secuenciación del BJGMC, Pune, fue el primero en identificar y marcar en rojo los aislados de SARS-CoV-2 identificados como BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 en la India. Hemos identificado 45 como BA.2.74, 14 como BA.2.75 y 21 como BA.2.76 hasta el 7 de julio. Se trata principalmente de variantes de BA.2 que han evolucionado con mutaciones añadidas además de las del progenitor (BA.2).

La mayoría de la población ha sido inmunizada contra el Covid-19. ¿Cuál es la eficacia de la vacuna contra estas subvariantes emergentes?

El BA.2 desempeñó un papel importante en la tercera ola de Covid-19 en la India. La mayor parte de la población de la India está inmunizada contra el virus gracias a su exitoso programa de vacunación. Además, las tres oleadas significan que la mayoría de las personas han estado expuestas a una inmunidad mediada por la vacuna o por la infección. Por lo tanto, para infectar a dicha población, el virus necesita evadir la inmunidad. Los anticuerpos contra las proteínas de pico de superficie del SARS-CoV-2 protegen a la persona contra la infección. Las mutaciones pueden cambiar la forma de ciertas partes de las proteínas de espiga, haciendo que los anticuerpos desarrollados tras la vacunación o la infección sean ineficaces. Esto conduce a la reinfección/infección por brotes.

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El virus evoluciona continuamente y además de la mutación presente en el BA.2, estos tres, BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76, han tenido mutaciones adicionales en su genoma que codifican las proteínas de espiga. Estas tres subvariantes han tenido más de nueve cambios en la proteína pico y están impulsando el aumento de las infecciones por Covid. Dos mutaciones, G4465 y R493Q, son los cambios clave en BA.2.75. Estas han sido identificadas esta semana, por lo que los estudios son esenciales para determinar la eficacia de la vacuna contra estas subvariantes emergentes. Sin embargo, dado que estas nuevas subvariantes se detectan en pacientes positivos a la RT-PCR en la oleada actual, su potencial de escape inmunológico ya está establecido.

Se están notificando casos de BA.4 y BA.5, pero su número aún no ha explotado. ¿Su opinión?

En cuanto a las variantes alarmantes, BA.2.12.1, BA.4 y BA.5, su número no ha explotado todavía. Es esencial una estrecha vigilancia mediante la secuenciación. También hay que evaluar el papel de la BA.2.38 y de estas tres nuevas subvariantes – BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 2 – en la reducción del número de BA.2.12.1, BA.4 y BA.5. Es esencial vigilar de cerca, mediante la secuenciación, el número de BA.2.75, ya que tiene nueve mutaciones más que las de su progenitor, BA.2.

¿Causarán estas nuevas subvariantes una forma más grave de infección?

Nuestros estudios clínicos anteriores en el BJGMC, Pune, mostraron que Omicron causaba infecciones leves y las tasas de hospitalización eran bajas. También habíamos realizado un estudio similar con respecto al sub linaje AY.4 de Delta durante la segunda oleada. Nuestro estudio del sub linaje codominante BA.2.38 mostró que los resultados clínicos eran como los de nuestro estudio anterior sobre Omicron. Hemos realizado un estudio clínico preliminar de 75 pacientes con infección por BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 y hemos comprobado que la mayoría tenía síntomas leves. Ninguno requirió oxígeno y no hubo muertes.

Durante el monzón, podría haber una mezcla de diferentes virus (dengue/chikungunya/ H1N1). Entonces, ¿cómo distinguir entre el Covid, que se comporta como la gripe estacional, y otras infecciones respiratorias?

Todos los virus causan fiebre. Las pruebas de diagnóstico microbiológico distinguen fácilmente estas infecciones víricas. Así, una prueba serológica/RT-PCR específica para estos virus (dengue, chikungunya y H1N1) identifica fácilmente estas infecciones virales.

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Apasionado del running, vegano a los 25 años y comercial de la ropa, apasionado de la criptomonedas, me incorporé al equipo de redacción de Impulsobajio en noviembre de 2021.